A Florianópolis House of Prayer apresenta seu  centro de treinamento, com várias opções de cursos presenciais e também ensino à distância.

É com a missão de equipar a igreja brasileira, que este centro de treinamento abrange diversas áreas de conhecimento e atuação, para que pessoas de todos os lugares da nação possam crescer no conhecimento das Escrituras, no relacionamento com Deus e estarem equipadas para operar no ministério.